河南科技学院生物工程学科依托学校长期形成的生物学、生物技术和生物工程教学科研基础建设发展。2021年11月，生物工程获批河南省硕士学位授权一级学科重点立项学科，现为一级学科硕士学位授权点。学科立足生物制造国家战略和河南省生物医药、绿色农业、食品发酵等产业发展需求，形成基因工程、动植物细胞工程和微生物发酵工程三个特色方向，重点开展基因编辑与生物药物、细胞工程与细胞工厂构建、微生物菌种改造、代谢调控与发酵工程等研究，着力培养能够从事生物体系设计、改造、优化与工程化研发及专业技术管理的高层次复合型工科人才。

学科拥有河南省天然产物与核酸药物设计及生物合成重点实验室、河南省药物合成生物学工程技术研究中心、河南省药用植物资源与利用工程研究中心等省级科研平台，仪器设备总值6610.85万元，实验室总面积7742平方米，配备激光共聚焦显微镜、超高效液相色谱/三重串联四极杆质谱联用仪、全自动膜片钳系统、气相色谱/质谱联用仪等大型仪器设备，为科学研究和研究生培养提供良好条件。2023—2025年，共获批国家自然科学基金青年项目2项、河南省科技研发联合基金（产业类）重大项目1项及多项省级科研项目，累计到位纵向科研经费157万元；获河南省教学成果一等奖、优秀科技论文一等奖等成果，在Foods、Industrial Crops and Products、Biochemical Engineering Journal等期刊发表SCI、CSCD论文近20篇，并在食用菌资源利用、微生物菌肥、天然产物制备等方面持续推进成果转化和产业服务。

学科现有专任教师30人，其中教授6人、副教授11人，博士23人，形成了以中青年骨干为主体、学缘结构合理的教学科研队伍。学科拥有一批承担国家自然科学基金、省级重大科研项目和产业技术项目的学术带头人与青年骨干，在生物药物、天然产物、食药用菌资源开发、微生物发酵、基因编辑与细胞工程等领域形成了稳定的科研团队，为生物工程高层次人才培养和区域生物制造产业发展提供了有力支撑。